常珊

发布者:计算机学院发布时间:2026-04-02浏览次数:799


姓名常珊
职务/职称教授
研究方向人工智能和生物信息
联系方式schang@jsut.edu.cn



博士,教授,硕士生导师,美国密苏里大学哥伦比亚分校博士后。担任中国生物信息学学会(筹)理事,中国疫苗行业协会疫苗基础研究专委会委员,江苏省生物信息学学会理事,《数据采集与处理》第七届编委会委员。在国内外期刊发表学术论文140余篇,被SCI检索120余篇,总被引用超过2400次,H指数为26,获得软件著作权14项,申请发明专利40项(授权12项),参与出版专著4部,译著1部。现主持国家自然科学基金面上项目1项,江苏省基础研究重点项目1项。完成国家自然科学基金2项,NSFC-广东联合基金(第二期)超级计算科学应用研究专项子课题1项,其他省部级和横向项目十余项。


主授课程

数据分析与可视化,程序设计,计算机网络与通信


荣誉与奖励

2021年,江苏省高等学校科学技术研究成果奖三等奖

2022年,CASP15比赛,蛋白质-配体(Ligand)预测赛道的第一

2023年,第十八届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛揭榜挂帅专项赛国家一等奖

2024年,江苏省高等学校科学技术研究成果奖三等奖

2024年,CASP16比赛RNA多聚体结构预测(z-score>-2.0)赛道的第一以及RNA-Ligand复合物结构预测第一

2024年,江苏省"现代化建设"建言献策一等奖

2025年,2024年度人民邮电出版社影响力作者奖


论文发表:

[1]Kejia Yan, Wangqiu He, Mingwei Pang, Xufeng Lu, Zhou Chen, Lianhua Piao, Han Zhang, Yu Wang, Shan Chang*, Ren Kong*. E3Docker: a docking server for potential E3 binder discovery. Nucleic Acids Research. 2025, 53(W1): W266-W272.

[2]Feng Wang, Jinming Chu, Liyan Shen*, Shan Chang*. MESM: integrating multi-source data for high-accuracy protein-protein interactions prediction through multimodal language models. BMC Biology. 2025, 23(1): 253.

[3]Da-Wei Zhang, Xiao-Shuang Xu, Lei Xu, Liangxu Xie, Yimin Li*, Shan Chang*. Mechanism-informed identification of FDA-approved topoisomerase inhibitors disrupting SARS-CoV-2 nucleocapsid-RNA interactions. BMC Chemistry. 2025, 19(1):322.

[4]Liangxu Xie, Guoming Bao, Dawei Zhang, Lei Xu, Xiaojun Xu*, Shan Chang*. Evaluating data partitioning strategies for accurate prediction of protein-ligand binding free energy changes in mutated proteins. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2025, 27:4418-4430.

[5]Shenhuan Ni, Chenghui Yang, Yutao Liu, Yuncong Zhang, Yiyan Shi, Anthony Qian, Ren Kong, Shan Chang*. GTpick: A deep neural network for Cryo-EM particle detection. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2025, 27:4451-4458.

[6]Lianhua Piao, Ying Gao, Xiaoshuang Xu, Yangyang Su, Yanong Daniel Wang, Jie Zhou, Yang Gao, Jin Fang, Qihui Li, Shan Chang*, Ren Kong*. Discovery of potent small molecule inhibitors of histone lysine methyltransferase NSDs. European Journal of Medicinal Chemistry. 2024, 268:16.

[7]Xiaohua Lu, Liangxu Xie*, Lei Xu, Rongzhi Mao, Xiaojun Xu*, Shan Chang*. Multimodal fused deep learning for drug property prediction: Integrating chemical language and molecular graph. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2024, 23:1666-1679.

[8]Kai Liu, Xufeng Lu, Hang Shi, Xiaojun Xu, Ren Kong*, Shan Chang*. nCoVDock2: a docking server to predict the binding modes between COVID-19 targets and its potential ligands. Nucleic Acids Research, 2023, 51(W1): W365–W371.

[9]Qiushi Cao, Cheng Ge, Xuejie Wang, Peta J. Harvey, Zixuan Zhang, Yuan Ma, Xianghong Wang, Xinying Jia, Mehdi Mobli, David J. Craik, Tao Jiang, Jinbo Yang, Zhiqiang Wei, Yan Wang*, Shan Chang*, Rilei Yu*. Designing antimicrobial peptides using deep learning and molecular dynamic simulations. Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(2): bbad058.

[10]Mingwei Pang, Wangqiu He, Xufeng Lu, Yuting She, Liangxu Xie, Ren Kong*, Shan Chang*. CoDock-Ligand: combined template-based docking and CNN-based scoring in ligand binding prediction. BMC Bioinformatics. 2023, 24(1): 14.


研究课题

1. 国家自然科学基金面上项目,针对蛋白质受体的多肽序列设计方法研究。

2. 江苏省基础研究重点项目,基于功能导向和多模态融合的蛋白质元件精准设计研究。